Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt20Q9D312 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt20Q9D312 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt20Q9D312 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms