Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps33aQ9D2N9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33aQ9D2N9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms