Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed5Q9CXE7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms