Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pin4Q9CWW6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pin4Q9CWW6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pin4Q9CWW6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms