Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd12Q9CWU0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms