Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BccipQ9CWI3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BccipQ9CWI3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BccipQ9CWI3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BccipQ9CWI3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms