Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud1Q9CUB6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud1Q9CUB6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud1Q9CUB6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otud1Q9CUB6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otud1Q9CUB6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otud1Q9CUB6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otud1Q9CUB6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud1Q9CUB6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud1Q9CUB6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud1Q9CUB6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud1Q9CUB6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms