Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NmbQ9CR53 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NmbQ9CR53 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NmbQ9CR53 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms