Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nudt21Q9CQF3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nudt21Q9CQF3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms