Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTRAFQ9CQE8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms