Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chchd1Q9CQA6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chchd1Q9CQA6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms