Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQ90 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQ90 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQ90 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQ90 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQ90 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQ90 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9CQ90 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQ90 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQ90 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQ90 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms