Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GpnmbQ99P91 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GpnmbQ99P91 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GpnmbQ99P91 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms