Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rims1Q99NE5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rims1Q99NE5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rims1Q99NE5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rims1Q99NE5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms