Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxp3Q99JB6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxp3Q99JB6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxp3Q99JB6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxp3Q99JB6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxp3Q99JB6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxp3Q99JB6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxp3Q99JB6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxp3Q99JB6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxp3Q99JB6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxp3Q99JB6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxp3Q99JB6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxp3Q99JB6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp3Q99JB6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxp3Q99JB6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxp3Q99JB6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms