Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg5Q99J83 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg5Q99J83 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg5Q99J83 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg5Q99J83 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg5Q99J83 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg5Q99J83 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg5Q99J83 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg5Q99J83 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg5Q99J83 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg5Q99J83 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg5Q99J83 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg5Q99J83 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg5Q99J83 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg5Q99J83 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms