Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nrbp1Q99J45 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrbp1Q99J45 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrbp1Q99J45 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms