Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sf3b3Q921M3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sf3b3Q921M3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sf3b3Q921M3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms