Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf6Q91YR7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prpf6Q91YR7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf6Q91YR7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms