Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lims2Q91XD2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lims2Q91XD2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lims2Q91XD2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms