Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klc3Q91W40 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Klc3Q91W40 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Klc3Q91W40 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klc3Q91W40 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms