Protein–RNA interactions for Protein: Q91VJ5

Pqbp1, Polyglutamine-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pqbp1Q91VJ5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pqbp1Q91VJ5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pqbp1Q91VJ5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pqbp1Q91VJ5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pqbp1Q91VJ5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pqbp1Q91VJ5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pqbp1Q91VJ5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pqbp1Q91VJ5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms