Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK0

Tmem30a, Cell cycle control protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30aQ8VEK0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem30aQ8VEK0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem30aQ8VEK0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem30aQ8VEK0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms