Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rprd1aQ8VDS4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rprd1aQ8VDS4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rprd1aQ8VDS4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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