Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sgip1Q8VD37 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgip1Q8VD37 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sgip1Q8VD37 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sgip1Q8VD37 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sgip1Q8VD37 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sgip1Q8VD37 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sgip1Q8VD37 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sgip1Q8VD37 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms