Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCA5

Tmprss4, Transmembrane protease serine 4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss4Q8VCA5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmprss4Q8VCA5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmprss4Q8VCA5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms