Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nup58Q8R332 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup58Q8R332 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms