Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gle1Q8R322 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gle1Q8R322 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms