Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Colec12Q8K4Q8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Colec12Q8K4Q8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms