Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Txndc11Q8K2W3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Txndc11Q8K2W3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Txndc11Q8K2W3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms