Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hacd3Q8K2C9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.3 ms