Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt1Q8K297 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt1Q8K297 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt1Q8K297 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt1Q8K297 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt1Q8K297 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt1Q8K297 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt1Q8K297 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt1Q8K297 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt1Q8K297 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt1Q8K297 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt1Q8K297 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Colgalt1Q8K297 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms