Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LgsnQ8CIX8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LgsnQ8CIX8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms