Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NgefQ8CHT1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NgefQ8CHT1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NgefQ8CHT1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms