Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim32Q8CH72 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim32Q8CH72 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim32Q8CH72 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim32Q8CH72 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim32Q8CH72 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim32Q8CH72 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim32Q8CH72 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim32Q8CH72 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim32Q8CH72 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim32Q8CH72 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim32Q8CH72 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim32Q8CH72 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim32Q8CH72 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim32Q8CH72 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim32Q8CH72 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim32Q8CH72 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim32Q8CH72 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim32Q8CH72 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim32Q8CH72 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms