Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc5Q8CAL5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gpc5Q8CAL5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gpc5Q8CAL5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc5Q8CAL5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms