Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Podxl2Q8CAE9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Podxl2Q8CAE9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Podxl2Q8CAE9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Podxl2Q8CAE9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms