Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam53cQ8BXQ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam53cQ8BXQ8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam53cQ8BXQ8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam53cQ8BXQ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam53cQ8BXQ8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam53cQ8BXQ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam53cQ8BXQ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam53cQ8BXQ8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam53cQ8BXQ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam53cQ8BXQ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam53cQ8BXQ8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam53cQ8BXQ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam53cQ8BXQ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam53cQ8BXQ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam53cQ8BXQ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam53cQ8BXQ8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam53cQ8BXQ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam53cQ8BXQ8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam53cQ8BXQ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam53cQ8BXQ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam53cQ8BXQ8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms