Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slx1bQ8BX32 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx1bQ8BX32 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx1bQ8BX32 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Slx1bQ8BX32 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slx1bQ8BX32 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 287.4 ms