Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp38Q8BW70 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp38Q8BW70 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp38Q8BW70 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp38Q8BW70 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
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