Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cc2d1bQ8BRN9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cc2d1bQ8BRN9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cc2d1bQ8BRN9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms