Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Susd4Q8BH32 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Susd4Q8BH32 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms