Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bhlhe23Q8BGW3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms