Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ChfrQ810L3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ChfrQ810L3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms