Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cracr2bQ80ZJ8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cracr2bQ80ZJ8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cracr2bQ80ZJ8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms