Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Amigo1Q80ZD8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Amigo1Q80ZD8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Amigo1Q80ZD8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.6 ms