Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WhrnQ80VW5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms