Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf8Q80TJ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf8Q80TJ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117 ms