Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PhkbQ7TSH2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PhkbQ7TSH2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PhkbQ7TSH2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PhkbQ7TSH2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PhkbQ7TSH2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PhkbQ7TSH2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PhkbQ7TSH2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PhkbQ7TSH2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PhkbQ7TSH2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PhkbQ7TSH2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PhkbQ7TSH2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PhkbQ7TSH2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PhkbQ7TSH2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PhkbQ7TSH2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PhkbQ7TSH2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PhkbQ7TSH2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PhkbQ7TSH2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PhkbQ7TSH2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PhkbQ7TSH2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms