Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdp1Q7TSG2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms